Od 1989 roku na terenie Warszawy działały dwie chorągwie harcerek: ZHR z komendantką hm. Agnieszką Ogrodowczyk, oraz ZHP rok zał. 1918 z komendantką Anną Ptaszek. Obie dążyły do odrodzenia harcerstwa żeńskiego, w oparciu o tradycje oraz Prawo i Przyrzeczenie Harcerskie z lat przedwojennych. Harcerstwa, które jest wartościowe dla harcerek, rozwija dziewczęta zwracając uwagę na ich indywidualne potrzeby.
Pierwszą komendantką która stanęła na czele zjednoczonych chorągwi była hm. Magdalena Dominiak (teraz Masiak).
ZHR – Wola, Żoliborz, Marymont, Centrum (żółty kolor na mapie)
ZHP r. zał. 1918 – Praga Płd., Grochów, Saska Kępa, Wawer, Mokotów (czerwony kolor na mapie)
We wrześniu 2025 roku z Mazowieckiej Chorągwi Harcerek wydzieliła się Warszawsko-Praska Chorągiew Harcerek „Sawa”, która swoim terenem działania objęła część Warszawy po prawej stronie Wisły oraz pobliskie miejscowości. Na czele nowej Chorągwi stanęła hm. Zuzanna Pajkowska HR.
| 1989 – 1992 hm. Agnieszka Ogrodowczyk HR (ZHR) |
| 1989 – 1992 Anna Ptaszek (z d. Kania) (ZHP r. z.1918) |
| 10. 1992 – 04.1995 hm. Magdalena Dominiak HR (później Masiak) |
| 04.1995 – 01.1997 phm. Aleksandra Bartkowiak wędr. |
| 01.1997 – 12.1998 phm. Małgorzata Wypych HR (z d. Przywała) |
| 12.1998 – 09.1999 hm. Aleksandra Lech HR (z d. Bartkowiak) |
| 09.1999 – 10.2001 hm. Magdalena Karowska-Koperwas HR (z d. Karowska) |
| 10.2001 – 17.04.2004 hm. Izabela Paczesna HR (z d. Marciniak) |
| 17.04.2004 – 1.04.2006 hm. Monika Jakubowska HR |
| 1.04.2006 – 15.03.2008 hm. Karolina Kolbuszewska HR |
| 15.03.2008 – 13.03.2010 hm. Ewa Ciosek HR |
| 13.03.2010 – 17.03.2012 hm. Barbara Brzewska HR |
| 17.03.2012 – 15.03.2014 hm. Alicja Dziewanowska HR |
| 15.03.2014 – 12.03.2016 hm. Małgorzata Rogowska HR |
| 12.03.2016 – 11.03.2018 hm. Alicja Dziewanowska HR |
| 11.03.2018 – 08.03.2020 hm. Bogumiła Rakusa-Suszczewska HR |
| 08.03.2020 – 12.03.2022 hm. Dorota Kapuścińska HR |
| 12.03.2022 – 09.03.2025 hm. Melania Karaś-Tęcza HR |
| 09.03.2025 – hm. Katarzyna Filiks HR |